大腸菌（Escherichia coli：エシェリキア・コリ）は、グラム陰性の桿菌で通性嫌気性菌に属し、環境中に存在する細菌（バクテリア）の主要な種の一つです。
腸内細菌の一種でもあり、温血動物（鳥類、哺乳類）の下流の消化管内、特にヒトなどの場合は大腸に生息し、好気的にも嫌気的にも増殖します。
しかし、鳥類病原性大腸菌（APEC）と呼ばれるような特定の株は、様々な内臓に広がって様々な病気を引き起こし、それらを総称して大腸菌症と呼ばれています。
APEC株は、セフラジン、クロラムフェニコール、スルホンアミド、アミノグリコシド、テトラサイクリン、βラクタム系抗生物質を含む多くの抗生物質に耐性を持つことが多い。
伝播:大腸菌は温血動物の糞便や下部腸管に多く生息しています。大腸菌が糞便中に排出されることで、この微生物は環境中に豊富に存在します。げっ歯類は鳥類病原性大腸菌（APEC）のキャリアであり、群れの汚染源となっています。
環境中での生存:糞尿中のpHが高くなると減少率が増加します。土壌や水などの開放環境での大腸菌の生存には、炭素基質などの資源の利用可能性が重要な要因であると考えられます。
分類
目:エンテロバクター目(Enterobacteriales)
科:腸内細菌科(Enterobacteriaceae)
属:エスケリキア属(Escherichia)
宿主
●動物
●人間
関連疾患
●趾瘤症（バンブルフット）
●卵黄嚢感染症
●蜂窩織炎
●大腸菌症
●気嚢炎
●卵黄腹膜炎
●敗血症
●耳の感染症
●骨髄炎
●精巣炎および精巣上体炎
