予防的投与
外科的感染症に対する化学療法薬の予防的投与の評価については前述を参照。予防的投与のその他の例としては、伝染病の感染予防（性病、コレラ、流行性髄膜炎）および感染症の発病阻止を目的とする長期予防投与（結核初感染、リウマチ熱、慢性気管支炎、慢性腎盂腎炎）があります。
また原虫性疾患（マラリア、アフリカ睡眠病）、リケッチアあるいはクラミジア感染症に対しても行われています。
特殊な条件下における化学療法薬の使用
（ⅰ）妊娠：催奇形性を有することが確実な、または可能性がある化学療法薬は、妊娠の初期（人では最初の3ヶ月間）および妊娠可能年齢のものには与えるべきではない。
これには、ゲンタマイシン、ストレプトマイシン、フラジオマイシン、ナリジキシン酸、リファンピシン、サルファ剤などがあります。テトラサイクリンを出産直前に大量に静注することは禁忌とされています。
妊娠が進むと、抗生物質の多くは、よく胎盤を通過する。しかし、臍帯血中の濃度は、一般に母体の血中濃度より低い(10～80%)。分娩後新生子による解毒が十分でないもの（クロラムフェニコール、アミノグリコシド系、テトラサイクリン、ノボビオシンなど）は、分娩直前の投与を慎重にすべきです。
（ⅱ）新生子期：肝、腎の解毒機能は、成熟子においても不十分なことが多く、未熟子ではそれが一層著しいから、クロラムフェニコール、アミノグリコシド系、サルファ剤については、減量および投与間隔の延長が必要です。
多くの抗生物質は母乳の中に分泌され、子によって摂取されますが、その量はわずかであって、子に障害をおこすことは例外的です。
（ⅲ）腎機能不全：排泄機能に障害がある場合には、化学療法薬の蓄積がおこる。腎機能が強く侵されると、排泄が糸球体濾過のみに依存するもの（セファロリジン、テトラサイクリン、ストレプトマイシン）や、糸球体で濾過され、かつ尿細管からも分泌されるもの（ペニシリン、セファロチン）は体内に蓄積されるから、投与間隔の延長と維持量の減少が必要になる。
クロラムフェニコール、ドキシサイクリン、スルファメトキサゾール、トリメソプリムは、腎不全の場合でも正常に血漿から消失する。
腎機能不全の際、できるだけ使用を避けるべきものは、次のようです：バシトラシン、ポリミキシン、ゲンタマイシン、カナマイシン、フラジオマイシン、ストレプトマイシン、メチシリン、サルファ剤、ナリジキシン酸など。
（ⅳ）肝機能不全：肝で主として、または全部が解毒される薬剤は、肝不全がある場合には禁忌です。また、肝疾患の際の使用には特別の注意が必要です。
たとえば、クロラムフェニコール、ノボビオシン、エリスロマイシン（特にエストレート）、サルファ剤、ナリジキシン酸、フシジン酸などです。
また肝毒性が報告されている薬もあります（テトラサイクリン、サルファ剤など）。
